Mitos Kota Thonis akhirnya terbukti wujud, ditemui tenggelam di lautan ini.Sebelum ini ramai menyangka bahawa kota legenda purba Thonis-Heracleion hanyalah sebuah mitos, namun penemuan ke atas kota tersebut pada tahun 2000 lalu sekali gus menyangkal dakwaan itu. Kota yang selama ini dikatakan mitos sebenarnya pernah wujud di bumi ini.
Kota purba ini dikatakan lenyap di kawasan Mediterranean sekitar 1200 tahun dahulu. Kota yang diselubungi misteri ini ditelan oleh Laut Mediterranean, dan tertanam di dalam pasir dan lumpur beribu tahun lamanya.
Hasil penemuan ini, ahli arkeologi telah membongkar misteri Heracleion, dan mendedahkan artifak-artifak menakjubkan yang masih terpelihara dengan baik. Kota ini dikenali sebagai Heracleion oleh orang-orang Yunani purba, dan orang-orang Mesir purba pula menyebut dengan nama Thonis.
Pertama kali kota ini telah ditemui semula pada tahun 2000 lalu oleh ahli arkeologi, iaitu Dr Franck Goddio dan pasukan dari European Institute for Underwater Acheology (IEASM). Mereka kemudian melakukan satu kajian geofizik selama empat tahun.
Mereka mula menjejak semula kota tersebut sebelum menemui bahagian-bahagian kota lama yang berada jauh di dasar laut. Penemuan tersebut bermula di bahagian utara pantai Mesir. Ciri-ciri yang terdapat pada sejarah, ukiran dan binaan yang terdapat di kota ini hampir menyerupai kota purba Atlantis.
Kumpulan mereka turut menemui 64 bangkai kapal pedagang yang dipercayai menjalankan urus niaga dengan penduduk kota tersebut, syiling emas dan patung-patung gergasi sebesar 16 kaki.
Runtuhan kota yang hilang itu ditemui 30 kaki di bawah permukaan Laut Mediterranean di Aboukir Bay, berhampiran Alexandria, Mesir. Mereka berjaya mengeluarkan pelbagai artifak keagamaan di bandar tenggelam itu, termasuk ukiran batu 16 kaki dan batu kapur (Sarcophagi) yang dipercayai mengandungi haiwan mumia.
Selain itu, pihaknya melaporkan turut menemui kepingan batu berukir tulis purba Yunani dan Mesir purba di tapak penemuan kota tersebut. Tetapi disebalik semua keseronokan atas penggalian itu, satu misteri tentang Thonis-Heracleion kekal sebahagian besarnya tidak dapat diselesaikan dengan tepat, mengapa ia tenggelam?
Berdasarkan teori awal penyelidik, kota tersebut dikatakan tergelincir ke dasar laut selepas ia dibina pada abad ke-8 sebelum Masihi. Sebelum kota Thonis-Heracleion hilang, dikatakan kota ini dibina sekitar muara Sungai Nil.
Andaian itu dibuat berdasarkan patung gergasi granit merah Dewa Hapi iaitu dewa Sungai Nil yang dijumpai bersama dengan penemuan kota tersebut. Antara teori lain yang turut dikemukakan termasuklah kenaikan paras air laut dan tragedi bencana alam yang menimpa menyebabkan kota tersebut terkubur ribuan tahun lamanya.
Pasukan penyelidik Goddio juga berpendapat bahawa berat bangunan besar yang didirikan di atas permukaan tanah liat menyebabkan air masuk dirantau itu, dan mungkin tanah pasir telah menyebabkan sebahagian besar kota itu tenggelam ekoran gempa bumi.